1998年3月9日，云南省建設廳批準成立云南工程勘察設計院，隸屬于云南省勘察設計協會，具有獨立法人資格、自主經營、自負盈虧、獨立核算的集體所有制單位。

1998年3月18日，院取得建筑工程設計丙級、工程勘察丙級和市政公用工程設計丙級資質。

1998年4月2日，院以自然人出資方式進行工商登記注冊，初始注冊資金為50萬元。

2002年10月10日，院建筑工程設計資質晉升為乙級。

2003年8月4日，并購昆明建龍建設監理有限公司為院下屬公司，并更名為昆明中厚建設監理有限公司，具有乙級工程建設監理資質。

2003年10月16日，昆明中厚建設監理有限公司成為云南省建設監理協會理事單位。

2004年8月15日 院取得ISO9001:2000標準國際質量管理體系認證證書。

2005年4月，院注冊資本增加至100萬元。